（一）关于准确率的误解
“亲子鉴定准确率达不到 100%”
事实上，正规鉴定采用 21 个以上 STR 基因位点检测，当亲权概率达到 99.99% 及以上时，即可认定亲子关系。从科学角度而言，99.99% 已接近绝对肯定，剩余 0.01% 的误差源于理论上的极小概率事件（如基因突变速率极低），但实际检测中通过增加位点数量可进一步降低误差，目前技术水平下错误率已低于百万分之一。
“血型不符就一定不是亲生”
血型遗传遵循孟德尔定律，但存在一定复杂性。例如父母均为 A 型血，子女可能是 A 型或 O 型；Rh 阴性血父母也可能生出 Rh 阳性血子女。血型只能作为初步排除依据，不能作为确认亲子关系的标准，最终需以 DNA 鉴定结果为准。
（二）样本采集的常见错误认知
“只有血液才能做鉴定”
除血液外，口腔拭子、带毛囊的毛发、指甲、烟头、牙刷等均可作为样本。其中口腔拭子因采集方便、无创，成为个人鉴定的首选；毛发需带有 3-5 毫米的白色毛囊（仅头发丝无效）；特殊样本如骨骼、牙齿需在专业机构处理后检测，只要样本中含有人体 DNA，均可用于鉴定。
“自行采集样本会影响结果”
只要遵循正确流程，自行采集的样本完全有效。例如采集口腔拭子时，用干净棉签在口腔内侧壁擦拭 15-20 次，自然晾干后装入纸质信封（避免塑料袋密封导致霉变）；烟头需收集 3-5 个近期吸食的，避免手触烟蒂部分。正规机构会对样本进行 DNA 浓度检测，合格后才进入实验流程。
（三）孕期鉴定的安全误解
“孕期鉴定会导致流产或胎儿畸形”
无创胎儿鉴定（怀孕 6 周以上）通过采集孕妇静脉血（含胎儿游离 DNA）完成，无需穿刺子宫，对胎儿和孕妇无创伤，与常规抽血检查风险相当。而传统的羊水穿刺或绒毛膜取样虽有 0.5%-1% 的流产风险，但属于医学检测中的低风险操作，目前临床已极少用于单纯亲子鉴定，多在医学指征下同步进行。
“胎儿鉴定结果不如出生后准确”
胎儿游离 DNA 来自胎盘滋养层细胞，与胎儿核 DNA 一致，检测原理和位点与出生后鉴定完全相同。只要样本合格（孕妇血液未受污染），两者准确率一致，均能达到 99.99% 以上。